按照規定，工廠屬于實際使用應稅集體所有建設用地、但未辦理土地使用權流轉手續的，由實際使用集體土地的單位來繳納城鎮土地使用稅。也就是誰使用、誰繳納。

注意一：

企業在有集體土地使用證的土地上建造的廠房，擁有了實際的所有權，也應繳納房產稅。

注意二：

直接用于農、林、牧、漁業的生產用地免征土地使用稅，也就是說直接從事于種植、養殖、飼養的專業用地，不包括農副產品加工場地和生活、辦公用地。

參考：

1、《財政部 國家稅務總局關于集體土地城鎮土地使用稅有關政策的通知》（財稅[2006]56號）：在城鎮土地使用稅征稅范圍內實際使用應稅集體所有建設用地、但未辦理土地使用權流轉手續的，由實際使用集體土地的單位和個人按規定繳納城鎮土地使用稅。

2、《財政部 稅務總局關于承租集體土地城鎮土地使用稅有關政策的通知》（財稅〔2017〕29號）：經研究，現將承租集體土地城鎮土地使用稅有關政策通知如下：在城鎮土地使用稅征稅范圍內，承租集體所有建設用地的，由直接從集體經濟組織承租土地的單位和個人，繳納城鎮土地使用稅。